唯信工坊 | 計算（AI）輔助藥物設計系列課程

ChatGPT火到出圈， AI技術又雙叒叕一次引爆全民熱議，各行各業競相探索新一代AI技術帶來的無限潛力。每個人都迫切希望掌握AI技能，以提高競爭實力，在未來的發展中搶占先機。

藥物研發領域首當其沖，作為藥學精英的你，是否已經心動已久了呢？AIDD、CADD、AlphaFold、Rosetta、Schrodinger、RDKit、Biopython、Pytorch、…… 你對這些名詞一定早已耳聞，但對于生物醫藥領域的初學者，或者長期從事實驗研究的你，能熟練靈活使用這些技術和工具軟件并不是一件容易的事，復雜的軟件操控界面，紛亂的命令格式、功能函數、設置參數，足以讓人心生畏懼、望而卻步。

網上免費課程多如牛毛，各種藥物設計培訓廣告鋪天蓋地，這些真能快速解決你眼前的問題嗎？你身邊的同學和同事，花了數天的時間跟班上課，遇到現實問題仍然是一頭霧水，效果往往差強人意。

有鑒于此，唯信團隊推出“唯信工坊”系列AIDD/CADD藥物設計課程，基于WeMol新一代AI藥物設計與計算平臺，引導藥物研發人員輕松入門，快速掌握主流藥物設計技術，真正掌握解決具體問題的能力。

唯信是國內最早從事藥物設計技術服務的老牌專業團隊之一，過去8年中，為國內外醫藥領域500+企事業單位提供過數千個各類項目的計算服務?；诖罅坑嬎惴諏嵺`，本課程歸納和整理了一線科研人員的最常見需求，精心設計大分子生物藥設計、小分子化學藥設計、分子模擬等主題培訓內容。讓你即學即用，一步跨入人工智能時代。

?AI計算，觸手可及

《唯信工坊》即日開放報名，首批課程面向抗體等大分子生物藥設計：

講師介紹

曾在恒瑞醫藥、先聲藥業等大型制藥企業擔任計算生物學負責人，作為核心成員參與過數十個臨床前新藥研發項目，十余個項目已經進入臨床研究階段，作為主要設計者研發的一款大分子藥物成功達成了數億美金海外授權。在NPR、JCIM等學術期刊發表SCI論文數十篇，被引500余次，并擔任多個期刊的審稿人。主持國家自然科學青年基金，參與國家新藥創制重大專項、科技部863計劃、自然科學基金重點和面上項目，申請新藥發明專利數十項（包括多項國際專利）和多項軟件著作權。

課程大綱

1.1.?蛋白晶體數據庫和結構檢索

1.2.?結構預測方法概述

1.3.?蛋白質結構通用預測方法

1.4.?抗體結構預測和優化

1.5.?基于AI的蛋白結構預測

1.6.?【經驗心得】實驗信息輔助的結構預測

2.1.?抗體可變區編號規則及異同

2.2.?對抗體可變區進行編號并識別CDR與FR

2.3.?使用EU規則對抗體恒定區進行編號

2.4.?TCR的可變區編號

3.1.?快速序列編輯與可視化標注

3.2.?多序列比對

3.3.?同源性計算

3.4.?氨基酸頻率分析與序列logo繪制

3.5.?進化分析與進化樹繪制

3.6.?多序列聚類分析及可視化

3.7.?【經驗心得】基于抗體CDR（忽略FR）進行序列分析

3.8.?【案例講解】快速制作、導出美觀的序列比對與分析圖表

4.1.?抗體人源化設計的原理與進展

4.2.?【案例講解】五分鐘完成抗體人源化設計

4.3. 【經驗心得】優化人源化設計：模板與回復突變的選擇

4.4.?【經驗心得】納米抗體人源化設計的異同

5.1.?蛋白的虛擬親和力成熟

5.2.?抗體的虛擬親和力成熟

6.1.?免疫原性預測的原理與進展

6.2.?【案例講解】一分鐘完成免疫原性預測

6.3.?【經驗心得】免疫原性預測結果分析與早期發現項目中的決策考量

6.4.?【經驗心得】去免疫原性改造策略與突變設計

6.5.?快速批量生成突變序列

7.1.?常見PTM風險位點預測

7.2.?【經驗心得】PTM位點突變策略

7.3.?理化性質預測（溶解度、等電點（pI）、聚集傾向等）

7.4.?蛋白質表面分析

7.5.?【案例講解】設計突變提升蛋白熱穩定性、表達量、純度

8.1.?氨基酸編碼轉換

8.2.?【案例講解】快速批量提取分析專利序列

8.3.?檢索專利保護的蛋白質序列

8.4.?基于抗體CDR的專利檢索

9.1.?基于已知序列進行優化設計

9.2.?特定區域的序列預測與生成

9.3.?從頭蛋白質設計

10.1.?DNA序列翻譯

10.2.?密碼子優化

10.3.?mRNA序列優化

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